Каждый вид архей и бактерий обладает геном 16S, ответственным за кодирование крошечной субъединицы рибосом. Этот ген содержит секции (V1–V9), которые демонстрируют значительную изменчивость и используются для целей таксономической категоризации. Ген также обладает консервативными частями, которые могут выступать в качестве мишеней для праймеров для амплификации чрезвычайно изменчивых областей.
Подход 16S рРНК в настоящее время широко используется для анализа сложных микробных сообществ благодаря внедрению секвенирования следующего поколения (NGS). Секвенирование следующего поколения (NGS) является наиболее эффективным методом изучения любого микробиома из-за ограничений секвенирования по Сэнгеру и методов на основе культивирования. Секвенирование по Сэнгеру не позволяет обнаружить множество бактерий в одном образце, в то время как методы на основе культивирования требуют много времени и часто не позволяют культивировать определенные виды бактерий.
Набор для подготовки микробиомной библиотеки EasySeq™ 16S использует технологию ПЦР с обратным комплементом (RC-PCR) для предоставления экономически эффективной и действенной методологии для характеристики микробиома. Этот набор позволяет анализировать гипервариабельные регионы V3-V4 в одной реакции, все в одной пробирке. Основным обоснованием использования областей V3-V4 является их высокая нуклеотидная изменчивость и превосходная дискриминационная способность, которые необходимы для оценки бактериального разнообразия и количественного определения микробного изобилия в различных типах образцов. Набор для подготовки микробиомной библиотеки EasySeq™ 16S имеет высокую чувствительность, что позволяет обнаруживать даже очень низкие уровни бактерий.